Le 22 mars 1991, un soulèvement populaire est réprimé dans le sang.
Le 26 mars 1991, un coup d’État militaire renverse Moussa Traoré. Un Comité de transition pour le salut du peuple est mis en place avec à sa tête le Lieutenant Colonel Amadou Toumani Touré. L’ancien président est emprisonné. Il sera, en 1993, condamné à mort. Cependant, le président Alpha Oumar Konaré commue sa peine en prison à vie puis, en mai 2002, le gracie.
En revanche, il doit dorénavant répondre de “crimes économiques”, pour lesquels il est aujourd’hui condamné.
Le Mouvement patriotique pour le renouveau (MPR) est un parti politique malien qui se réclame de Moussa Traoré.
Cheick Modibo Diarra, ancien Premier ministre du Mali, est marié avec sa fille.