Les anciennes graines ont été trouvées sur un site archéologique appelé Uan Muhuggiag, dans ce qui est aujourd’hui le désert du Sahara, dans le sud de la Libye.
Pour révéler l’origine des graines, les scientifiques ont utilisé des techniques “d’archéo-génomique”, l’analyse de génomes anciens.
L’archéo-génomique est une “machine à remonter le temps” et un “travail de détective”, selon le chercheur colombien Óscar Alejandro Pérez-Escobar, auteur principal de la nouvelle étude et expert en analyse de l’ADN ancien et des orchidées au London Botanic Gardens, Kew Gardens.
“Lorsque l’on séquence les restes de plantes vieilles de milliers d’années, le taux de réussite est très faible, généralement un ou deux pour cent de l’ADN de ces plantes peuvent être récupérés”, a déclaré Pérez-Escobar à BBC Mundo.
L’un des aspects les plus novateurs de notre étude est que nous avons pu décoder environ 30 % du code génétique de graines vieilles de 6 000 ans dont l’identité était inconnue.
“De tous les restes de plantes très anciennes qui ont été caractérisés génétiquement, ce sont les plus anciens qui ont été séquencés jusqu’à présent.
“Les scientifiques ont comparé l’ADN des graines avec celui d’autres graines du Soudan, vieux d’environ 3 000 ans, et avec des graines d’herbiers de Kew Gardens collectées au cours des 150 dernières années.
“Et nous avons réalisé que les graines libyennes, bien que génétiquement liées à la pastèque que nous mangeons aujourd’hui, étaient très différentes.”
Blanc, amer et potentiellement mortel
En étudiant quels gènes étaient présents dans les graines et en sachant quels traits chaque gène contrôle, les scientifiques ont déchiffré à quoi ressemblait la pastèque consommée il y a 6 000 ans.
“C’est ainsi que nous avons réalisé qu’avec un haut degré de probabilité cette pastèque était amère et que sa pulpe était blanche”, a déclaré Pérez Escobar.
La pulpe avait également “une teneur élevée en un composé appelé cucurbitacine, qui donne à certaines citrouilles leur goût amer”.
“C’est un composé qui, s’il est consommé en quantité importante, peut entraîner la mort”.
La cucurbitacine se trouve principalement dans un groupe de plantes connues sous le nom de Cucurbitaceae, qui comprend les citrouilles, les melons et les pastèques. La toxicité de ce composé est due à une adaptation pour prévenir les dommages causés par les prédateurs.”
Aujourd’hui encore, certaines espèces sauvages de pastèques peuvent provoquer une intoxication en raison de leur teneur élevée en cucurbitacine, a souligné le chercheur.
“Des cas d’empoisonnement, voire de décès, ont été signalés en Europe et en Asie chez des personnes qui se sont confondues avec des pastèques sauvages ou ont consommé des citrouilles à forte teneur en cucurbitacine.
“Contrairement à la pulpe, les graines ne contiennent pas de cucurbitacine, qui est extrêmement amère”, a déclaré Susanne Renner, chercheuse à l’Université de Washington aux États-Unis et co-auteure principale de l’étude.
Un autre des auteurs, Guillaume Chomicki, de l’Université de Sheffield en Angleterre, a déclaré que les pastèques “semblent avoir été initialement récoltées ou cultivées pour leurs graines. Cela correspond aux marques de dents humaines sur les graines trouvées en Libye”.